政治中心／綜合報導
雙方第二階段詰問時，連勝文質疑柯文哲不僅是綠，而且是墨綠，並質疑柯曾表示當選市長就是釋放陳水扁最好的時機。此外認為柯文哲的環南市場重建工程，會在颱風期間造成市民困擾。而柯表示要將台北市重開機，連表示山寨機重開機也不會變iPhone，質疑柯文哲當選後要劃掉5000個停車位，此般造成市民困擾，難道要市民一直重複被折磨嗎？
對於連勝文的提問，柯語重心長表示之所以表達自己為墨綠立場，是為了證明連勝文的頭部的槍傷是真的。他對待連勝文就像對待其他病人一樣，就像對待阿扁一樣。從一個醫生的角度來看，他認為陳水扁目前病況已經是一個廢人的狀態，但是如何處理這個問題是可以討論的，但是今天連郝龍斌市長也支持陳水扁保外就醫，讓陳水扁死在獄中真的符合台灣的社會利益嗎？
另外柯文哲重申對手如果用不正當手段選舉，如何期待當選後會用正當手段來執政？最後柯文哲表示環南市場部分相當複雜，颱風期間的確需要有兩到三天的停市，可以之後再詳細討論。柯表示以他個人來講，他主張一次改建，就像做為一個外科醫生本來就比較急，他傾向一次解決。
連勝文再追問，之前柯文哲了選舉把我個人、邵曉鈴女士、金溥聰先生的病例都公諸於世，未來如果醫院的院長都會這麼做？另外，在《大屠殺》書中，指你有做器官移植，又如何解釋？到底是誰在說謊？
柯文哲則回應，去打聽一下就知道是真的還是假，吳奕輝醫師就知道是真假，柯文哲並秀出文件，指葛德曼律師的信件在這，證實這不是真的，三週內會有更詳細清楚的說明。柯文哲更反批，「明明知道這是假的」，還是選擇要這樣打，不斷的造假抹黑，違背良心，強調根本沒有的事，這場選舉是價值的選擇，選民定會做出選擇。
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